第二季的故事發生在第一季結束八年後，軍情六處的特工喬納森·派恩（湯姆·希德勒斯頓 飾）以爲自己徹底埋葬了過去，如今他的化名叫作亞歷克斯·古德溫，在倫敦負責主導一個祕密監視小組，生活平靜安逸。然而某晚，他偶然瞥見一位過去受僱於理查德的傭兵，並促使他再次行動，與哥倫比亞商人泰迪·多斯·桑託斯（迭戈·卡爾瓦 飾）發生衝突。